El edificio fue construido originalmente en 1755-65 como el claustro del Convento de la Inmaculada Concepción (Las Monjas). Asociado con el Instituto Nacional de Bellas Artes (INBA) de México, este antiguo lugar de oración y contemplación es ahora una especie de Iglesia de Arte. Además, a lo largo de la pared norte del claustro, en un espacio que albergaba el refectorio de las monjas, es probablemente la obra de arte más famosa de San Miguel de Allende, un mural inacabado pero poderoso de Davíd Alfaro Siqueiros. Uno de los famosos triunvirales de los muralistas mexicanos.

La construcción del recito comenzó en 1755 y diez años después se inauguró con el traslado de religiosas al nuevo edificio. El templo se encontraba aún inconcluso, le faltaban las torres, campanario presbiterio y altares, mismos que se concluyeron durante la primera mitad del siglo XIX. Fué obra del maestro albañil Zeferino Gutiérrez inspirándose en la iglesia de los Inválidos del París, y, asesorado por un gran artista mexicano conocido como el Dr. Atl.